どれもセルフホストなら無料。
Outline – Team knowledge base & wiki
https://www.getoutline.com/
がっつりNotionライクで、使いやすそう。
SiYuan - Markdown,ブロックレベル参照,双方向リンクをサポートするプライバシー第1のナレッジ管理システム
https://b3log.org/siyuan/en/
おそらくVScodeベースのUI。
Obsidian - Sharpen your thinking
https://obsidian.md/
老舗でプラグインなども多く、完成度が高いが、無料セルフホストではWebUIが使えない。またアプリ起動が少し遅い。
The Everything App
https://anytype.io/
非常に美しいUI。Obsidiaん同様、サーバーホストではんくローカルアプリの保存フォルダをクラウドで同期する形式。動作は軽いが、Obsidianほど拡張性はない。